టొమాటో బ్రౌన్ రుగోస్ ఫ్రూట్ వైరస్ ప్రపంచవ్యాప్తంగా టొమాటో మరియు మిరియాల మొక్కలను సోకడంతో, విత్తన కంపెనీలు నిరోధక టమోటాను పెంచే పనిలో ఉన్నాయి.
టొమాటో జెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ ప్రాజెక్ట్లు ప్రారంభించడానికి ముందే టొమాటో పెంపకందారులకు రిచ్ జెనెటిక్ మరియు జెనోమిక్ వనరులు అందుబాటులో ఉన్నాయి. పెద్ద టొమాటో జెర్మ్ప్లాజమ్ సేకరణలు చాలా కాలంగా అనేక ప్రదేశాలలో స్థాపించబడ్డాయి. ప్రపంచవ్యాప్తంగా 75,000 కంటే ఎక్కువ టమోటా ప్రవేశాలు జన్యుబ్యాంకులలో భద్రపరచబడ్డాయి. జెనీవా, NY వద్ద ఉన్న USDA జన్యుబ్యాంక్ అతిపెద్ద వాటిలో ఒకటి.
టొమాటో జన్యువు యొక్క సీక్వెన్సింగ్ 2005 దేశాల మధ్య బహుళజాతి ప్రయత్నంగా 14లో ప్రారంభించబడింది మరియు 2012లో పూర్తయింది. పెద్ద మొత్తంలో జన్యు మరియు సమలక్షణ డేటాను విశ్లేషించడానికి కృత్రిమ మేధస్సు, మెషిన్ లెర్నింగ్ మరియు అధునాతన అల్గారిథమ్ల అప్లికేషన్తో ఈ ప్రయత్నాలు చాలా వేగవంతం చేయబడ్డాయి.
టొమాటో పాన్-జీనోమ్
2020లో బోయ్స్ థాంప్సన్ ఇన్స్టిట్యూట్ పరిశోధకులు అడవి టొమాటోలు మరింత పూర్తి మరియు ఉపయోగకరమైన టొమాటో పాన్-జీనోమ్ను ఉత్పత్తి చేయడానికి అధిక-నాణ్యత సూచన జన్యువును రూపొందించారు. పండ్ల రుచి, పరిమాణం మరియు పక్వత, ఒత్తిడిని తట్టుకునే శక్తి మరియు వ్యాధి నిరోధకతను కలిగి ఉండే జన్యువు యొక్క విభాగాలను వారు కనుగొన్నారు. DNA యొక్క చాలా పొడవైన ముక్కలను చదవగలిగే అత్యాధునిక సీక్వెన్సింగ్ సాంకేతికతలకు ధన్యవాదాలు, రిఫరెన్స్ జీనోమ్ ఇప్పటికే ఉన్న డేటాబేస్ కంటే పూర్తి మరియు ఖచ్చితమైనది.
DNA యొక్క చిన్న ముక్కలను చదివే పాత సీక్వెన్సింగ్ సాంకేతికతలు సింగిల్-బేస్ స్థాయిలో ఉత్పరివర్తనాలను గుర్తిస్తాయి. అయినప్పటికీ, DNA యొక్క పెద్ద భాగాల ఇన్సర్షన్లు, తొలగింపులు, విలోమాలు లేదా నకిలీలు వంటి నిర్మాణాత్మక వైవిధ్యాలను కనుగొనడంలో అవి మంచివి కావు.
2019లో, అంతర్జాతీయ పరిశోధకుల బృందం 725 ఫైలోజెనెటికల్గా మరియు భౌగోళికంగా ప్రాతినిధ్య రకాల్లోని జన్యు శ్రేణులను ఉపయోగించి టమోటా పాన్-జీనోమ్ను నిర్మించింది. ఈ డేటాబేస్ అసలు రిఫరెన్స్ జీనోమ్లో కనిపించని 4,873 జన్యువులను కలిగి ఉంది. ప్రస్తుత/హాజరుకాని వైవిధ్య విశ్లేషణలు టమోటా పెంపకం మరియు మెరుగుదల సమయంలో గణనీయమైన జన్యు నష్టం మరియు జన్యువులు మరియు ప్రమోటర్ల యొక్క తీవ్రమైన ప్రతికూల ఎంపికను వెల్లడించాయి.
www.seedworld.comలో పూర్తి కథనాన్ని చదవండి.